교육혁신단은 1969년 시청각교육연구원으로 설립되어 1994년 미디어의 활용이 활발해짐에 따라 교육매체원으로 기관명을 변경하였다. 이후 1998년에는 멀티미디어 및 이화의 사이버교육을 전담하는 멀티미디어교육원으로 개편되었으며, 2008년부터 이화교수학습센터와 업무를 통합하여 교수학습에 대한 토탈서비스 기관으로의 역할을 수행하면서 교수학습개발원으로 기관을 재조직한 바 있다.
이러한 대학교육 지원의 전통과 전문성을 가진 본교 교수학습지원기관은 2015년 대학교육의 질적 혁신을 선도하고 지식의 사회적 공유와 확산에 대한 필요성에 따라 총장직속 교육혁신단으로 조직을 개편하였고 그 아래에 교육혁신센터와 미래혁신센터를 두고 있다.
